Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF18Q9UNG2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF18Q9UNG2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms