Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRQQ9UMZ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRQQ9UMZ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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