Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALD1Q9ULE6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALD1Q9ULE6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PALD1Q9ULE6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms