Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ZNF608Q9ULD9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ZNF608Q9ULD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ZNF608Q9ULD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 442.4 ms