Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNOT11Q9UKZ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT11Q9UKZ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms