Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH13Q9UKX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYH13Q9UKX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYH13Q9UKX3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms