Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMFRQ9UKV5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMFRQ9UKV5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMFRQ9UKV5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms