Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTBP2Q9UKA9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms