Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCP2D1Q9UJQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms