Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSRAQ9UJ68 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSRAQ9UJ68 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRAQ9UJ68 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms