Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF11Q9UIL8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF11Q9UIL8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF11Q9UIL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms