Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATPIF1Q9UII2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms