Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHORDC1Q9UHD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHORDC1Q9UHD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms