Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
IFT172Q9UG01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
IFT172Q9UG01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
IFT172Q9UG01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms