Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms