Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLIP2Q9UDT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIP2Q9UDT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms