Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DKK4Q9UBT3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DKK4Q9UBT3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DKK4Q9UBT3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms