Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPASTQ9UBP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPASTQ9UBP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPASTQ9UBP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms