Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE7Q9UBL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE7Q9UBL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms