Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL13Q9P2N7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL13Q9P2N7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms