Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARSQ9P2J5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LARSQ9P2J5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms