Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS18Q9P253 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS18Q9P253 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS18Q9P253 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms