Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTN3Q9P232 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTN3Q9P232 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms