Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC88CQ9P219 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC88CQ9P219 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms