Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCHIP1Q9P0W5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCHIP1Q9P0W5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms