Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDUFA13Q9P0J0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDUFA13Q9P0J0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms