Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP5Q9NZZ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP5Q9NZZ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP5Q9NZZ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms