Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKD2L2Q9NZM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L2Q9NZM6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKD2L2Q9NZM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms