Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLL3Q9NYJ7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DLL3Q9NYJ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLL3Q9NYJ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms