Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXC10Q9NYD6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC10Q9NYD6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms