Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VNN3Q9NY84 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VNN3Q9NY84 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VNN3Q9NY84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms