Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARHL2Q9NY43 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARHL2Q9NY43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARHL2Q9NY43 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms