Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3EQ9NVU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3EQ9NVU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3EQ9NVU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms