Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDFIP2Q9NV92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms