Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACER3Q9NUN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACER3Q9NUN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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