Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMILIN3Q9NT22 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EMILIN3Q9NT22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms