Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SDR39U1Q9NRG7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms