Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DUOX1Q9NRD9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DUOX1Q9NRD9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms