Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO6Q9NRD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO6Q9NRD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO6Q9NRD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO6Q9NRD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO6Q9NRD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms