Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBN5Q9NRC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBN5Q9NRC6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBN5Q9NRC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms