Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGEF3Q9NR81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF3Q9NR81 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF3Q9NR81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms