Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF3Q9NR23 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms