Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf4Q9NR00 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
C8orf4Q9NR00 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf4Q9NR00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms