Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNK9Q9NPC2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNK9Q9NPC2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms