Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TREM1Q9NP99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREM1Q9NP99 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms