Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNPLA8Q9NP80 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA8Q9NP80 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms