Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VCX3AQ9NNX9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VCX3AQ9NNX9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VCX3AQ9NNX9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms