Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUFT1Q9NNX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUFT1Q9NNX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms