Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX8Q9HC52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX8Q9HC52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms