Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDFQ9HBH1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDFQ9HBH1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms